Protocoles puce séquentielles

séquentielle immunoprécipitation de la chromatine , connu sous le nom SeqChIP , est un test biologique destiné à définir la façon dont les deux protéines interagissent au sein d'une région d'un acide désoxyribonucléique (ADN ) brin . Les chercheurs se livrent un ensemble spécifique de tâches ordonnées à révéler trois relations possibles entre les protéines en cours d'évaluation . Comme avec la plupart des tests scientifiques , il les êtres avec nettoyage et se termine avec la conclusion . Selon des chercheurs de Harvard , les progrès technologiques dans l'analyse de SeqChIP peuvent permettre aux scientifiques d'étudier de façon plus générale des phénomènes biologiques . Préparer

expériences SeqChIP contiennent une préparation minutieuse afin de désinfecter et nettoyer les billes magnétiques pour l'expérience . Les chercheurs doivent se laver les billes à plusieurs reprises et les nettoyer dans une solution « en bloc» . Les perles sont ensuite mises en suspension pour le séchage et re- lavées . En général , les scientifiques quittent un jour avant le lavage final avant de passer à l'étape de liaison . Compte tenu de la nature de la variation de brins d'ADN pour l'évaluation , cette étape de la préparation varie également en complexité . Cependant , une vérité scientifique reste : le nettoyeur de l'essai, le nettoyeur le résultat

Crosslink

scientifiques sélectionner complexes d'ADN de protéines , ou des zones dans le brin , pour l'amélioration . avec un anticorps. En effet , les biologistes juxtaposent protéines afin d'observer leur interaction . Une fois observé , réticulation doit être confirmée dans l'ordre inverse . Ne les protéines se rapportent encore lorsque la séquence est inversée ? Scientifiques SeqChIP croient que la co- existence de deux protéines quand évalué dans la direction opposée de fournir des preuves convaincantes de co- occupation complète , et permet la différenciation sans ambiguïté de l'occupation partielle et pas de co- occupation .

Purifier

Polymerase Chain Reaction ou " PCR ", est un processus ADN - amplification qui vérifie la qualité ou la pureté , de l'ADN . La PCR est réalisée en trois étapes. Tout d'abord , la PCR fait fondre les brins séparés par élévation de la température . Ensuite , les chercheurs amener les deux brins de la matrice de retour avec des amorces de PCR . Enfin , les biologistes incuber l'ADN ainsi que des amorces de polymérase provoquent des cellules en cours d'examen au cluster. De là , les chercheurs se déplacent à l'examen des clusters.
Évaluer

analyse examine les brins d'ADN pour la présence ou l'absence de " occupation ", une relation interactive entre protéines. Deux protéines qui s'associent toujours avec le même fragment d'ADN ont terminé co- occupation; pas de co- occupation se produit lorsque les protéines ne peuvent associer dans les sous-populations mutuellement exclusives du brin d'ADN; co- occupation partielle signifie que certaines des molécules d'ADN ont tous les deux des protéines , alors que d'autres ont une ou l'autre. Si les tests de SeqChIP est une procédure dans le volet de la biologie , il offre aux scientifiques la possibilité d'appliquer les résultats singuliers à une structure génomique entier.