Comment comparer les méthodes d'électrophorèse de gel d'ADN
gel d'agarose est la méthode la plus courante pour la visualisation de l'ADN . Différents pourcentages d' agarose peuvent être utilisées en fonction de la taille de l' ADN devant être visualisée. Un faible pourcentage d' agarose , tel que 0,7 pour cent , a la résolution de visualiser grands fragments d'ADN . Un pourcentage plus élevé , tel que de 2 pour cent , est souvent utilisé pour visualiser de petits fragments d' ADN . Pour visualiser l'ADN , le bromure d'éthidium est souvent utilisé comme il s'intercale avec l'ADN et fluorescence à la lumière UV .
Polyacrylamide
Les gels de polyacrylamide sont utilisés à des fragments d'ADN séparés aussi petites que 10 paires de bases jusqu'à 1 kb. Ces gels ont un petit intervalle de séparation mais avec une haute résolution . Cependant, ils sont aussi plus compliqué à préparer. Il est également possible de charger de grandes quantités d' ADN , sans affecter la résolution. Comme agarose , le bromure d'éthidium est souvent utilisé pour visualiser les fragments d'ADN , mais polyacrylamide peut étancher la fluorescence , ce qui rend difficile de visualiser de petites quantités d' ADN .
Pulse - champ et Photos
Cette forme de l'électrophorèse est utilisée pour séparer les grandes molécules d'ADN et est souvent utilisé pour le génotypage . Grands fragments d'ADN migrent à une vitesse similaire . Il peut être difficile , donc , pour résoudre différentes bandes . Électrophorèse en champ puisé alternance du champ électrique. Cela permet une meilleure séparation et la résolution de l'ADN .
Capillaire
électrophorèse capillaire est une méthode rapide et sensible pour la séparation de l'ADN . De petites quantités d' ADN peuvent être résolus. L'ADN peut être visualisé avec un marquage fluorescent ou à la lumière UV .
Dénaturation
La séparation de l'ADN peut être compliquée par sa structure . Il est possible en utilisant de l'urée et de formamide de détruire la structure en abaissant le point de fusion de l'ADN . Il peut être utilisé dans les deux gels d'agarose et de polyacrylamide .
Considérations
La méthode de l'électrophorèse choisi dépendra de la taille des fragments d'ADN à séparer. Comment l'ADN sera utilisé après la séparation permettra également de déterminer la méthode finale .